Ученые выяснили структуру важнейшего фермента ВИЧ

Ученые после 20 лет безуспешных попыток выяснили структуру белка вируса иммунодефицита человека, с помощью которого тот "встраивает" свои гены в ДНК пораженной клетки, что может привести к созданию новых методик борьбы с распространением смертоносного вируса. Определить структуру белка интегразы, с помощью которого ВИЧ и другие ретровирусы "встраивают" свои гены, сумела группа британских и американских исследователей во главе с Петром Черепановым из Имперского колледжа Лондона. На блокировании активности этого фермента основан принцип действия самых современных препаратов против ВИЧ, но механизм их действия остается загадкой для самих фармацевтов. До сих пор ученые не знали, как фермент взаимодействует с ДНК. Для этого надо было получить белок в кристаллической форме, исследовать его структуру с помощью рентгеноструктурного анализа. Никому из массы ученых их научных групп не удалось получить интегразу ВИЧ в форме высококачественных кристаллов, пригодных для анализа. Группа Черепанова начала изучение интегразы другого ретровируса - PFV (Prototype Foamy Virus), так называемого пенного вируса человека, не вызывающего развитие каких-либо болезней. Изучив особенности функционирования интегразы этого вируса, ученые пришли к выводу, что она по своей структуре должна быть аналогична интегразе ВИЧ. После этого 4 года ученые предпринимали более 40 тыс. попыток вырастить кристалл белка. В 7 случаях попытки были успешны, но для рентгеноструктурного анализа пригодным оказался 1. Структуру полученного кристалла изучили с помощью мощного рентгеновского излучения, полученного с помощью синхротрона Diamond Light Source в южном Оксфордшире. Структура оказалась не похожей на то, как ее представляли. Исследователи сумели изучить взаимодействие интегразы с медицинскими антиретровирусными препаратами, ингибирующими ее активность - ралтегравира (Raltegravir) и элвитегравира (Elvitegravir) - благодаря чему механизм их действия понятен, а сами препараты могут быть улучшены.