Митрополит Мануил (Павлов) родился 26 октября 1950 г. в Ленинграде.
В 1974 г. закончил Ленинградскую духовную семинарию, в 1979 г. — Ленинградскую духовную академию.
1 января 1976 г. принял монашеский постриг, 4 января рукоположен во иеродиакона, 7 января — во иеромонаха.
В 1976-1977 гг. — клирик Николо-Богоявленского собора в Ленинграде.
В 1977-1978 гг. проходил стажировку в Экуменическом институте в Боссэ (Швейцария).
В 1978-1980 гг. — преподаватель Ленинградской духовной семинарии.
21 ноября 1982 г. получил ученую степень кандидата богословия за курсовое сочинение «Церковные реформы Петра I и их историко-критическая оценка».
В 1980-1982 гг. и с июня 1987 г. — благочинный церквей Олонецкой епархии, настоятель Крестовоздвиженского собора г. Петрозаводска.
В 1982-1985 гг. — секретарь Ленинградского епархиального управления. В 1985-1986 гг. — и.о. ректора Ленинградских духовных школ. В 1986-1987 гг. — настоятель Тихвинского храма в г. Тихвине.
Решением Священного Синода от 20 июля 1990 г. избран епископом Петрозаводским и Олонецким.
Хиротония состоялась 14 августа 1990 г. в Крестовоздвиженском соборе г. Петрозаводска. Богослужение совершили Святейший Патриарх Алексий II, митрополит Ленинградский и Ладожский Иоанн, архиепископы Курский и Белгородский Ювеналий и Дюссельдорфский Лонгин, епископы Ульяновский и Мелекесский Прокл, Новгородский и Старорусский Лев, Костромской и Галичский Александр, Истринский Арсений и Подольский Виктор.
С 17 июля 1996 г. — Петрозаводский и Карельский.
25 февраля 2000 г. возведен в сан архиепископа.
Решением Священного Синода от 29 мая 2013 г. (журнал № 41) назначен главой новообразованной Карельской митрополии.
11 июля 2013 г. за Божественной литургией в Спасо-Преображенском соборе Валаамского монастыря Святейшим Патриархом Кириллом возведен в сан митрополита.